Étude d’association pangénomique (GWAS)

Définition

Définition et périmètre

Le premier exemple marquant de cette méthode, publié en 2005 pour la dégénérescence maculaire liée à l’âge, a ouvert la voie à des bilans réguliers du champ montrant que les traits comportementaux et psychiatriques complexes sont massivement polygéniques, chaque variant identifié n’expliquant individuellement qu’une fraction infime, souvent inférieure à un dixième de pour cent, de la variation totale du trait. Une partie substantielle de l’héritabilité estimée par les études de jumeaux reste néanmoins non retrouvée par les variants identifiés à ce jour, un écart connu sous le nom d’héritabilité manquante et activement étudié.Klein, 2005 · Manolio, 2009

Cette notion décrit un fonctionnement possible, dont l’intensité et les effets varient selon la situation. La reconnaître suppose d’examiner ce qui la déclenche, la fonction qu’elle prend et ce qu’elle produit dans le temps, plutôt que de s’arrêter à une conduite isolée.Klein, 2005 · Manolio, 2009

Comprendre

Mécanisme et fonction

Étude d’association pangénomique (GWAS) dépend de la manière dont l’information est sélectionnée, interprétée et maintenue disponible. Le processus peut être rapide ou réfléchi, volontaire ou partiellement automatique ; ces dimensions doivent être distinguées avant de lui attribuer une cause unique.Manolio, 2009 · Visscher, 2012 · Visscher, 2017

Son caractère utile ou coûteux dépend moins de sa simple présence que de sa fréquence, de sa souplesse et de son ajustement au contexte. Un fonctionnement ponctuel peut soutenir l’adaptation ; le même fonctionnement, devenu automatique ou exclusif, peut réduire les possibilités de réponse.Manolio, 2009 · Visscher, 2012 · Visscher, 2017

Observer

Formes et variations

Les exemples rendent la notion plus concrète sans en faire une règle générale. Un même comportement peut remplir une autre fonction dans une autre situation.Manolio, 2009 · Visscher, 2012 · Visscher, 2017

• Une étude d’association pangénomique teste plusieurs centaines de milliers de variants génétiques sur un échantillon de plus de cent mille personnes.
• Une variante génétique associée au niveau d’études n’explique individuellement qu’une fraction infime de la variance totale, malgré un résultat statistiquement significatif.

Distinguer

Notions proches et limites

Étude d’association pangénomique (GWAS) est notamment rapproché de Gène candidat et Score de risque polygénique. Ces relations signalent des recouvrements possibles, pas des synonymes : deux notions peuvent produire des conduites semblables tout en différant par leur déclencheur, leur fonction ou leur temporalité.Visscher, 2012 · Visscher, 2017

La notion devient peu informative lorsqu’elle est utilisée comme une étiquette globale. Elle gagne au contraire en précision lorsqu’on peut décrire les situations où elle apparaît, les changements qui la modifient et les observations qui contrediraient l’hypothèse.Manolio, 2009 · Visscher, 2012 · Visscher, 2017